Биологический каталог




Ферменты рестрикции и их применение

Автор А.А.Янулайтис

Burbank D. et al. «Nucl. Acids Res.*, 1986, 14, 6017—6030.

299. Yamada Y., Yoshioka H. et al. «J. Gen. Appl. Microbiol.*, 1983, 29, 157—166.

300. Yoshimori R. PhD Thesis, University of California, San Francisco, 1971.

301. Yoshimori R., Roulland-Dussoix D. et al. «J. Bacteriol.*, 1972, 112, 1275—1279.

302. Yoshioka H., Nakamura H. et al. «Agric. Biol. Chem.*, 1983, 47, 2871— 2879.

303. Zain B. S., Roberts R. J. «J. Mol. Biol.*, 1977, 115, 249—255.

СОДЕРЖАН И Е

От редактора................ 3

А. А. Янулайтис. Ферменты рестрикции и их применение. 4

Введение ................. 4

Часть I. ФЕРМЕНТЫ РЕСТРИКЦИИ II ТИПА..... 6

1. Ферменты рестрикции, их номенклатура и классификация . . 6

2. Распространение рестриктаз........... 12

3. Таксоиоспецифичность рестриктаз......... 25

4. Характеристика субстратной специфичности рестриктаз ... 33

4.1. Узнаваемая последовательность нуклеотидов...... 33

4.2. Релаксироваиная специфичность рестриктаз...... 41

4.3. Место расщепления субстрата.......... 43

4.4. Специфичность рестриктаз в отношении природных модификаций основания............... 45

4.4.1. Специфичность рестриктаз по отношению к местоположению модифицированного основания.......... 47

4.4.2. Чувствительность рестриктаз к природе минорного основания 48

4.4.3. Сводные данные о чувствительности рестриктаз к модификациям субстрата.............. 49

4.4.4. Чувствительность изошизомеров к местоположению метилированного основания............. 57

4.4.5. Чувствительность рестриктаз к m5CG и m5CNG метилированию субстрата............... 58-

4.4.6. Чувствительность рестриктаз к dam и dcm зависимому метилированию ............... 58

4.4.7. Чувствительность метилаз к модификациям субстрата ... 62

4.5. Практическое применение сведений о различных проявлениях субстратной специфичности рестриктаз........ 63.

5. Физико-химические свойства рестрикционных эндонуклеаз ... 66

6. Ферментативные свойства рестриктаз........ 68

6.1. Каталитические свойства рестрикционных эндонуклеаз ... 69

6.1.1. Эффективные кинетические параметры....... 69'

6.1.2. Механизм реакции гидролиза кольцевых форм ДНК эндонуклеазами рестрикции ........... 70

6.1.3. Исследование процесса гидролиза линейных форм ДНК эндонуклеазами рестрикции........... 74

6.1.4. Гидролиз синтетических олигонуклеотидов эндонуклеазами рестрикции ................ 76-

6.1.5. Расщепление однонитевой ДНК эндонуклеазами рестрикции . 77

7. Взаимодействие рестриктаз II типа с модифицированными субстратами ................. 78

7.1. Роль отдельных групп атомов гетероциклических оснований участка узнавания............. 79-

7.1.1. Аденин................ 80

7.1.2. Тимин................ 82

7.1.3. Цитозии............... 84

7.1.4. Гуанин................ 87

7.2. Влияние нуклеотидных последовательностей, фланкирующих участок узнавания.............. 88

7.3. Взаимодействие рестриктаз с углеводфосфатным остовом участка узнавания............... 90

7.3.1. Фосфатные группы............. 90

7.3.2. Углеводный остаток............ 92

7.4. Некоторые аспекты взаимодействия рестриктаз с отдельным иук-леотидом (или его звеном) участка узнавания..... 94

8. Рентгеноструктурное исследование комплекса рестриктазы EcoR I

с субстратом............... 96

9. Молекулярная генетика ферментов рестрикции-модификации . . 100

202

5,1. Структура генов рестрикции-модификации...... 101

д.2 Регуляция экспрессии генов рестрикции-модификации . . . . 104

9.2.1. Структура регуляторных областей генов rm...... 105

9.2.2. Возможные механизмы скоординированной экспрессии генов rm 107 g3. Гомология генов, кодирующих ферменты рестрикции-модификации 114

Литература................ 116

Часть II. МЕТОДИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ РЕСТРИКТАЗ ................ 126

1. Определение активности рестриктаз......... 126

2. Поиск продуцентов рестриктаз.......... 130*

2.1. Биологические подходы к поиску продуцентов рестриктаз . . 131

2.2. Биохимические методы поиска продуцентов специфических эндонуклеаз ................ 135

3. Очистка рестриктаз . . ........... 141

3.1. Получение бесклеточных экстрактов........ 144

3.2. Разделение нуклеиновых кислот и рестриктаз...... 144

3.2.1. Нехроматографические методы......... 145

3.2.2. Хроматографические методы разделения нуклеиновых кислот и рестриктаз............... 148

3.3. Методы, используемые для очистки рестриктаз..... 154

3.4. Возможные перспективные направления развития препаративной биохимии рестриктаз............ 160

3.4.1. Высокоэффективная жидкостная хроматография ... 160

3.4.2. Новые методические подходы к разработке схем очистки . . 161

3.5. Выделение гомогенных препаратов рестриктаз..... 162

4. Определение субстратной специфичности рестриктаз . . . 170

4.1. Косвенные методы определения узнаваемого участка . . . 170

4.2. Методы определения места расщепления субстрата . . 173

5. Клонирование геиов рестрикции-модификации...... 180

5.1. Методические аспекты клонирования генов rm..... 185

5.2. Факторы, влияющие на успешное клонирование генов rm . . 188

5.2.1. Скоординированная экспрессия......... 188

5.2.2. Ограничение модифицированной ДНК....... 191

5.3. Конструирование продуцентов рестриктаз и метилаз .... 193 Литература................ 195

Технический редактор В. С. Рябова Корректор В. В. Рассказова

Сдано в набор 28.07.89 Подписано в печать 06.10.89 Т—15133

Формат бумаги бОХЭО'Аб Бум. кн.-журн. Литературная гарнитура

Высокая печать. Усл. печ. л. 12,75 Усл. кр.-отт. 12,94 Уч.-изд. л. 14,53

Тираж 500 Заказ 5933 Цена 1 р. 50 к.

Адрес редакции: 125219, Москва, А-219, Балтийская ул., 14. Тел. 155-42-12

Производственно-издательский комбинат ВИНИТИ,

140010, Люберцы, 10. Московской обл., Октябрьский просп., 403

УДК 577.21

А. А. Янулайтис. Ферменты рестрикции и их применение — Итоги науки и техники. ВИНИТИ. Биотехнология, т. 17, 1989. 1—201

Обзор содержит информацию о способах поиска, характеристики, свойствах и использовании ферментов рестрикции, ключевой группы ферментов, необходимых для проведения современных теоретических и прикладных молекулярио-биологических исследований. Библ. 722

Зак. 5933

страница 73
< К СПИСКУ КНИГ > 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73

Скачать книгу "Ферменты рестрикции и их применение" (1.59Mb)


[каталог]  [статьи]  [доска объявлений]  [обратная связь]

п»ї
Rambler's Top100 Химический каталог

Copyright © 2009
(17.09.2019)